培養(yǎng)基的優(yōu)化方法
日期:2023-12-22 | 中海生物技術(shù)文庫 | 瀏覽:1275 次
營(yíng)養(yǎng)成分、比列、pH值、滲透壓都會(huì)對(duì)微生物生長(zhǎng)造成影響,怎樣才能達(dá)到最佳的組合、滿足微生物生長(zhǎng)的各項(xiàng)指標(biāo)?那就需要對(duì)培養(yǎng)基進(jìn)行各種優(yōu)化,以滿足微生物的生長(zhǎng)需要。目前實(shí)驗(yàn)室常用的有單因素試驗(yàn)法、正交實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、響應(yīng)面優(yōu)化設(shè)計(jì)法。
單因素試驗(yàn)法
單因素試驗(yàn)是指因素間假設(shè)沒有相互作用的前提下,一個(gè)實(shí)驗(yàn)中只有一個(gè)因素在變化,而其它因素保持恒定不變的實(shí)驗(yàn)。通過一次改變一個(gè)因素的水平而其它因素保持水平不變來確定整個(gè)實(shí)驗(yàn)中該因素所起的作用,然后一個(gè)個(gè)因素進(jìn)行試驗(yàn)的優(yōu)化方法。但當(dāng)實(shí)驗(yàn)因素較多時(shí),需要多次的試驗(yàn)次數(shù)及較長(zhǎng)的試驗(yàn)時(shí)間,才能完成每個(gè)因素的篩選優(yōu)化,最終確定培養(yǎng)基的成分、條件等。單因素試驗(yàn)法通常是用來確定碳源和氮源以及它們的配比,然后再進(jìn)行正交試驗(yàn)。但大多數(shù)培養(yǎng)基成分都比較復(fù)雜,實(shí)驗(yàn)因素間經(jīng)常存在交互作用,不能獲得最佳的優(yōu)化結(jié)果。所以培養(yǎng)基的優(yōu)化試驗(yàn)一般不采用單因素試驗(yàn)法,而采用正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)法。
正交試驗(yàn)法
正交試驗(yàn)法是根據(jù)試驗(yàn)的需要,找出試驗(yàn)中具有代表性的多因素,利用一套表格選擇多因素、多水平,設(shè)計(jì)合理的試驗(yàn),找出它們之間存在的交互作用,尋找最佳因素水平結(jié)合,大大減少試驗(yàn)次數(shù),較快地取得實(shí)驗(yàn)結(jié)果。正交試驗(yàn)法利用的是普通統(tǒng)計(jì)分析方法來分析試驗(yàn)結(jié)果,對(duì)因素的個(gè)數(shù)沒有嚴(yán)格的限制,不管因素之間有無交互作用都可使用。正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)的因素、水平合理,分布均勻,不需要反復(fù)試驗(yàn),誤差小、特別是在試驗(yàn)因素、水平很多、因素之間的交互作用很多時(shí),正交試驗(yàn)法具有明顯的優(yōu)勢(shì),單因素試驗(yàn)幾乎無法完成。比如吳亞麗等人用正交試驗(yàn)通過搖瓶發(fā)酵確定了最佳培養(yǎng)基是基因菌株融合蛋白,用這種優(yōu)化培養(yǎng)基使GST融合蛋白的量提高到1.8g/L,占總蛋白質(zhì)量的25%。
正交試驗(yàn)法注重的是科學(xué)合理地安排試驗(yàn),但它仍有一定局限性,不能找出全部因素和水平之間的關(guān)系,只能是一個(gè)大概值,不能準(zhǔn)確給出因素和水平的一個(gè)最優(yōu)值。而且試驗(yàn)的次數(shù)很多,在試驗(yàn)工作中應(yīng)用范圍還是受到一的定限制。
響應(yīng)面優(yōu)化法
響應(yīng)面優(yōu)化法是利用數(shù)學(xué)統(tǒng)計(jì)方法找出多因素與響應(yīng)面之間結(jié)合的最佳條件,得出一個(gè)數(shù)學(xué)函數(shù)方程,用它對(duì)受變量影響的響應(yīng)面進(jìn)行建模和分析,將響應(yīng)面進(jìn)行優(yōu)化,通過因素與響應(yīng)面的函數(shù)關(guān)系快速建模,減少實(shí)驗(yàn)的次數(shù)和時(shí)間,用最經(jīng)濟(jì)的方法和最短的時(shí)間全面進(jìn)行試驗(yàn)研究,準(zhǔn)確地找到整個(gè)區(qū)域內(nèi)因素與面的函數(shù)關(guān)系,從而獲得較好的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。響應(yīng)面優(yōu)化法用回歸函數(shù)方程式作為估算工具,將多因素實(shí)驗(yàn)中因素與響應(yīng)面的關(guān)系,用多項(xiàng)式來近似,使其實(shí)驗(yàn)結(jié)果函數(shù)化,依據(jù)函數(shù)方程式對(duì)整個(gè)面進(jìn)行全面分析,研究因素與響應(yīng)值之間,因素與因素之間的關(guān)系,并進(jìn)行優(yōu)化,從而減少實(shí)驗(yàn)的工作量。姜麗艷、李雪等人用響應(yīng)面優(yōu)化法對(duì)乳鏈菌肽液體發(fā)酵培養(yǎng)基的響應(yīng)區(qū)域進(jìn)行水平的優(yōu)化,優(yōu)化后的乳鏈菌肽效價(jià)是優(yōu)化前的4.48倍。
響應(yīng)面優(yōu)化法得到的數(shù)據(jù)更精確、更全面,哪怕是對(duì)試驗(yàn)有顯著影響的因素都可以用響應(yīng)面優(yōu)化法進(jìn)行優(yōu)化。
還有不常用的均勻?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)法、二次正交旋轉(zhuǎn)組合法、遺傳算法與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等幾種方法,在培養(yǎng)基優(yōu)化中都會(huì)用到,關(guān)鍵是根據(jù)實(shí)驗(yàn)的需要,這里就不再一一敘述。
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